MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	ATTTT	2	10	2253	2262	20 %	80 %	0 %	0 %	452202138
2	NC_020381	T	6	6	2259	2264	0 %	100 %	0 %	0 %	452202138
3	NC_020381	AGT	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202138
4	NC_020381	AGA	2	6	2374	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202138
5	NC_020381	TAA	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202138
6	NC_020381	GAC	2	6	2435	2440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202138
7	NC_020381	TAA	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202138
8	NC_020381	CTGTA	2	10	2497	2506	20 %	40 %	20 %	20 %	452202138
9	NC_020381	TCGA	2	8	2513	2520	25 %	25 %	25 %	25 %	452202138
10	NC_020381	GTT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202138
11	NC_020381	CCT	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202138
12	NC_020381	AAT	2	6	2597	2602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202138
13	NC_020381	TCAT	2	8	2628	2635	25 %	50 %	0 %	25 %	452202138
14	NC_020381	GATA	2	8	2639	2646	50 %	25 %	25 %	0 %	452202138
15	NC_020381	TTA	2	6	2709	2714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202138
16	NC_020381	AC	3	6	2722	2727	50 %	0 %	0 %	50 %	452202138
17	NC_020381	T	6	6	2739	2744	0 %	100 %	0 %	0 %	452202138
18	NC_020381	CAA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202138
19	NC_020381	TTG	2	6	2825	2830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202138
20	NC_020381	CTA	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202138
21	NC_020381	TAAGA	2	10	3061	3070	60 %	20 %	20 %	0 %	452202138
22	NC_020381	TGT	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202139
23	NC_020381	ATT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202139
24	NC_020381	T	6	6	3229	3234	0 %	100 %	0 %	0 %	452202139
25	NC_020381	A	7	7	3239	3245	100 %	0 %	0 %	0 %	452202139
26	NC_020381	AAT	2	6	3265	3270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202139
27	NC_020381	AT	3	6	3272	3277	50 %	50 %	0 %	0 %	452202139
28	NC_020381	T	6	6	3285	3290	0 %	100 %	0 %	0 %	452202139
29	NC_020381	T	7	7	3313	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	452202139
30	NC_020381	TGT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202139
31	NC_020381	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	452202139
32	NC_020381	TTC	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202139
33	NC_020381	AT	3	6	3376	3381	50 %	50 %	0 %	0 %	452202139
34	NC_020381	CT	3	6	3394	3399	0 %	50 %	0 %	50 %	452202139
35	NC_020381	TA	3	6	3502	3507	50 %	50 %	0 %	0 %	452202140
36	NC_020381	GCC	2	6	3611	3616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452202140
37	NC_020381	AAAAT	2	10	3660	3669	80 %	20 %	0 %	0 %	452202140
38	NC_020381	CAA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202140
39	NC_020381	TCT	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202140
40	NC_020381	ATC	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202140
41	NC_020381	T	6	6	3864	3869	0 %	100 %	0 %	0 %	452202140
42	NC_020381	TAA	3	9	3889	3897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202140
43	NC_020381	CAT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202140
44	NC_020381	CAAAAT	2	12	3922	3933	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	452202140
45	NC_020381	TAC	2	6	3964	3969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202140
46	NC_020381	CTA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202140
47	NC_020381	TTC	2	6	4118	4123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202140
48	NC_020381	AAC	2	6	4124	4129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202140
49	NC_020381	CTT	2	6	4210	4215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202140
50	NC_020381	T	6	6	4222	4227	0 %	100 %	0 %	0 %	452202140
51	NC_020381	TTAG	2	8	4247	4254	25 %	50 %	25 %	0 %	452202141
52	NC_020381	T	6	6	4255	4260	0 %	100 %	0 %	0 %	452202141
53	NC_020381	GTT	2	6	4315	4320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202141
54	NC_020381	T	6	6	4333	4338	0 %	100 %	0 %	0 %	452202141
55	NC_020381	ACC	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202141
56	NC_020381	CTT	2	6	4462	4467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202141
57	NC_020381	CTA	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202141
58	NC_020381	TGA	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202141
59	NC_020381	TTA	2	6	4524	4529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202141
60	NC_020381	T	6	6	4596	4601	0 %	100 %	0 %	0 %	452202141
61	NC_020381	TA	3	6	4699	4704	50 %	50 %	0 %	0 %	452202142
62	NC_020381	CTT	2	6	4739	4744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
63	NC_020381	TTTC	2	8	4754	4761	0 %	75 %	0 %	25 %	452202142
64	NC_020381	CTA	2	6	4813	4818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202142
65	NC_020381	TTC	2	6	4860	4865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
66	NC_020381	GTT	2	6	4909	4914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202142
67	NC_020381	CTAT	2	8	4924	4931	25 %	50 %	0 %	25 %	452202142
68	NC_020381	TCA	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202142
69	NC_020381	TTG	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202142
70	NC_020381	TA	3	6	5058	5063	50 %	50 %	0 %	0 %	452202142
71	NC_020381	AATTT	2	10	5092	5101	40 %	60 %	0 %	0 %	452202142
72	NC_020381	CTT	2	6	5114	5119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
73	NC_020381	AAC	2	6	5136	5141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202142
74	NC_020381	CTT	2	6	5153	5158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
75	NC_020381	TTC	2	6	5232	5237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202142
76	NC_020381	TTA	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202142
77	NC_020381	CTGT	2	8	5317	5324	0 %	50 %	25 %	25 %	452202142
78	NC_020381	TC	3	6	5337	5342	0 %	50 %	0 %	50 %	452202142
79	NC_020381	CCT	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202143
80	NC_020381	TAA	2	6	5427	5432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202143
81	NC_020381	GAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202143
82	NC_020381	ATAA	2	8	5481	5488	75 %	25 %	0 %	0 %	452202143
83	NC_020381	TTG	2	6	5524	5529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202143
84	NC_020381	AGA	3	9	5919	5927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202144
85	NC_020381	A	7	7	5962	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	452202144
86	NC_020381	ATT	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202144
87	NC_020381	T	6	6	6027	6032	0 %	100 %	0 %	0 %	452202144
88	NC_020381	GAA	2	6	6038	6043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202144
89	NC_020381	A	6	6	6100	6105	100 %	0 %	0 %	0 %	452202144
90	NC_020381	GAA	2	6	6187	6192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202144
91	NC_020381	ATAA	2	8	6247	6254	75 %	25 %	0 %	0 %	452202144
92	NC_020381	TAC	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202145
93	NC_020381	AGC	2	6	6350	6355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202145
94	NC_020381	CAAC	2	8	6367	6374	50 %	0 %	0 %	50 %	452202145
95	NC_020381	T	6	6	6409	6414	0 %	100 %	0 %	0 %	452202145
96	NC_020381	CAT	2	6	6434	6439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202145
97	NC_020381	ATA	2	6	6454	6459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202145
98	NC_020381	ATTT	2	8	6622	6629	25 %	75 %	0 %	0 %	452202145
99	NC_020381	ATT	2	6	6638	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202145
100	NC_020381	GCAT	2	8	6662	6669	25 %	25 %	25 %	25 %	452202145
101	NC_020381	TC	3	6	6700	6705	0 %	50 %	0 %	50 %	452202145
102	NC_020381	GAA	2	6	6723	6728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202145
103	NC_020381	TTA	3	9	6729	6737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202145
104	NC_020381	AAT	2	6	6943	6948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202146
105	NC_020381	AC	3	6	7211	7216	50 %	0 %	0 %	50 %	452202147
106	NC_020381	CTT	2	6	7290	7295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202147
107	NC_020381	AAC	2	6	7320	7325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202147
108	NC_020381	AG	3	6	7338	7343	50 %	0 %	50 %	0 %	452202147
109	NC_020381	AAT	2	6	7406	7411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202147
110	NC_020381	A	7	7	7444	7450	100 %	0 %	0 %	0 %	452202147
111	NC_020381	TTCTT	2	10	7560	7569	0 %	80 %	0 %	20 %	452202147
112	NC_020381	ATG	2	6	7574	7579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202147
113	NC_020381	GGC	2	6	7603	7608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452202147
114	NC_020381	TTTC	2	8	7611	7618	0 %	75 %	0 %	25 %	452202147
115	NC_020381	TGC	2	6	7648	7653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202147
116	NC_020381	AATGC	2	10	7665	7674	40 %	20 %	20 %	20 %	452202147
117	NC_020381	TAA	2	6	7683	7688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202147
118	NC_020381	AGA	2	6	7696	7701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202147
119	NC_020381	GCTT	2	8	7705	7712	0 %	50 %	25 %	25 %	452202147
120	NC_020381	TCT	2	6	8085	8090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202148
121	NC_020381	AGC	2	6	8140	8145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202148
122	NC_020381	TAAAT	2	10	8155	8164	60 %	40 %	0 %	0 %	452202148
123	NC_020381	TTC	2	6	8326	8331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202149
124	NC_020381	CAA	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202149
125	NC_020381	TCT	2	6	8395	8400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202149
126	NC_020381	T	6	6	8400	8405	0 %	100 %	0 %	0 %	452202149
127	NC_020381	ACA	2	6	8703	8708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202150
128	NC_020381	GAA	2	6	8709	8714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202150
129	NC_020381	AAG	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202150
130	NC_020381	AGA	2	6	8750	8755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202150
131	NC_020381	GCA	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202150
132	NC_020381	TTA	2	6	8793	8798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202150
133	NC_020381	AAT	2	6	8799	8804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202150
134	NC_020381	A	6	6	8830	8835	100 %	0 %	0 %	0 %	452202150
135	NC_020381	CAA	2	6	8988	8993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202151
136	NC_020381	TAA	2	6	9007	9012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202151
137	NC_020381	GGAT	2	8	9026	9033	25 %	25 %	50 %	0 %	452202151
138	NC_020381	TACA	2	8	9120	9127	50 %	25 %	0 %	25 %	452202151
139	NC_020381	A	6	6	9175	9180	100 %	0 %	0 %	0 %	452202151
140	NC_020381	GAA	2	6	9203	9208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202151
141	NC_020381	ATG	2	6	9264	9269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202151
142	NC_020381	GAA	4	12	9344	9355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202151
143	NC_020381	GA	3	6	9420	9425	50 %	0 %	50 %	0 %	452202151
144	NC_020381	A	6	6	9435	9440	100 %	0 %	0 %	0 %	452202151
145	NC_020381	ACG	2	6	9488	9493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202151
146	NC_020381	TAA	2	6	9519	9524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202151
147	NC_020381	GAA	2	6	9533	9538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202151
148	NC_020381	A	6	6	9537	9542	100 %	0 %	0 %	0 %	452202151
149	NC_020381	TTGGG	2	10	9631	9640	0 %	40 %	60 %	0 %	452202151
150	NC_020381	AGA	2	6	9643	9648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202151
151	NC_020381	ATC	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202151
152	NC_020381	GAA	3	9	9689	9697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202151
153	NC_020381	A	7	7	9721	9727	100 %	0 %	0 %	0 %	452202151
154	NC_020381	ATTAAA	2	12	9738	9749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202151
155	NC_020381	TCA	2	6	9778	9783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202152
156	NC_020381	TTA	2	6	9784	9789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202152
157	NC_020381	CTG	2	6	9818	9823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202152
158	NC_020381	AT	3	6	9935	9940	50 %	50 %	0 %	0 %	452202152
159	NC_020381	A	6	6	9955	9960	100 %	0 %	0 %	0 %	452202152
160	NC_020381	AATT	2	8	9962	9969	50 %	50 %	0 %	0 %	452202152
161	NC_020381	TTAC	2	8	10000	10007	25 %	50 %	0 %	25 %	452202152
162	NC_020381	ATA	2	6	10013	10018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202152
163	NC_020381	TAA	2	6	10053	10058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202152
164	NC_020381	TCA	2	6	10096	10101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202152
165	NC_020381	GGA	2	6	10153	10158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202152
166	NC_020381	A	6	6	10256	10261	100 %	0 %	0 %	0 %	452202152
167	NC_020381	TGA	2	6	10278	10283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202152
168	NC_020381	ATA	2	6	10286	10291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202152
169	NC_020381	A	6	6	10304	10309	100 %	0 %	0 %	0 %	452202152
170	NC_020381	GAA	2	6	10345	10350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202152
171	NC_020381	AAC	2	6	10367	10372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202152
172	NC_020381	GTA	2	6	10396	10401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202152
173	NC_020381	TTAC	2	8	10436	10443	25 %	50 %	0 %	25 %	452202152
174	NC_020381	CTG	2	6	10451	10456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202152
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178	NC_020381	AC	3	6	10535	10540	50 %	0 %	0 %	50 %	452202152
179	NC_020381	ATC	2	6	10550	10555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202152
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181	NC_020381	A	6	6	10592	10597	100 %	0 %	0 %	0 %	452202152
182	NC_020381	AGA	3	9	10614	10622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202152
183	NC_020381	TTC	2	6	10630	10635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202152
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192	NC_020381	TA	3	6	11066	11071	50 %	50 %	0 %	0 %	452202153
193	NC_020381	GA	3	6	11151	11156	50 %	0 %	50 %	0 %	452202153
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199	NC_020381	AAT	2	6	11426	11431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202154
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260	NC_020381	AAGT	2	8	14815	14822	50 %	25 %	25 %	0 %	452202160
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265	NC_020381	AGAAAA	2	12	15053	15064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	452202160
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267	NC_020381	ATG	2	6	15082	15087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202160
268	NC_020381	TGAATT	2	12	15113	15124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	452202160
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270	NC_020381	A	6	6	15288	15293	100 %	0 %	0 %	0 %	452202161
271	NC_020381	AATG	2	8	15346	15353	50 %	25 %	25 %	0 %	452202161
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